Vernichtung wertvoller Lebensräume
Durch die Abbaggerungen und den massenhaften Verbau von Schottersteinen an den Flussufern werden wertvolle Lebensräume und Brutplätze für viele, teilweise stark bedrohte Arten wie Flussregenpfeiffer und Flussseeschwalbe zerstört. Auch Biberbauten, Uferschwalbenbrutkolonien und Eisvogelbruthöhlen verschwinden, wenn Abbruchufer befestigt werden.
Große Bereiche der mittleren Elbe sind zudem Bestandteil des europaweiten Schutzgebiets Natura 2000. Die Ausbaumaßnahmen würden hier massive Beschädigung von Flächen bedeuten, denen die EU nach der Flora-Fauna-Habitat- Richtlinie einen besonderen Schutzstatus zuerkannt hat. Die großräumige Erhaltung dieser letzten noch relativ naturnahen Flußauen ist also auch eine internationale Verpflichtung.